自建房仅有土地证而无房产证时，通常情况下难以办理过户手续。房产证是房屋产权的重要凭证，完整的房产过户流程一般需同时考量土地证与房产证。仅持有土地证，意味着房屋产权情况存在不明确性。缺少房产证，无法确切证明房屋合法的建造手续及产权归属，这会给交易带来较大风险。根据现行法律法规，办理房产过户需确保房屋产权清晰、证件齐全。自建房若无房产证，可能存在未依法取得建设规划许可等问题，不符合过户的基本条件。在实际操作中，建议先咨询当地不动产登记部门，了解该自建房未能取得房产证的原因。若因手续不全导致，应及时补办相关手续，待取得完整产权证件后，再行考虑过户事宜，以保障交易的合法性与安全性，避免后续可能产生的纠纷与损失。

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