国有土地自建房过户费用标准如下：一、契税按房屋评估价的一定比例征收，通常在1%-3%左右。具体比例依据房屋面积及购房者情况而定，如首套房面积在90平方米及以下，契税税率为1%；90平方米以上，税率为1.5%。二套房面积在90平方米及以下，契税税率为1%；90平方米以上，税率为2%。三套及以上住房，契税税率一般为3%。二、增值税视房屋是否满两年而定。若房屋购买满两年，免征增值税；未满两年，则需按照房屋评估价的5%左右缴纳。三、个人所得税一般按照房屋评估价的1%或房屋转让所得的20%征收。若该自建房为卖家家庭唯一住房且满五年，则免征个人所得税。四、土地出让金需根据当地规定计算缴纳，通常为房屋评估价的一定比例，比如1%-5%等，具体比例因地区而异。五、其他费用还可能涉及房屋评估费、登记费、交易手续费等。房屋评估费一般为评估价的千分之几；登记费按件收取，通常在几十元到上百元不等；交易手续费按房屋面积计算，每平方米几元到十几元不等。

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