农村房屋占用赔偿的确定需综合多方面因素考量。首先，要依据房屋的合法建筑面积进行核算。对于有合法产权证明的部分，按照重置成本结合成新等方式评估价值，以此作为赔偿基础。其次，房屋内的装修及附属设施也会纳入赔偿范围，根据其实际价值给予相应补偿。再者，因房屋占用导致的搬迁费用，包括临时安置的费用等，都应由占用方承担。另外，如果房屋具有经营性质，因占用造成的停产停业损失，也需按照合理的标准进行赔偿，通常会参考经营状况、收益水平等因素来确定。赔偿方式一般有货币补偿，即直接给予一定金额的货币；也有产权调换，提供安置房屋等。具体赔偿标准和方式需遵循当地相关政策法规以及具体的征收或占用方案，以确保公平合理地保障房屋所有者的合法权益。

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