合同被盗后的处理措施如下：首先，应尽快确定合同被盗的事实。仔细检查办公场所、存储设备等，查看是否存在异常迹象。同时，梳理与合同相关的人员及近期的工作往来情况，排查可能接触到合同的人员范围。其次，及时采取补救措施。例如，如果合同涉及重要商业信息，可考虑向相关部门报备，如工商行政管理部门等，以防止信息被非法利用。对于需要履行的合同义务，与合作方沟通说明情况，必要时提供其他相关证明材料，如交易记录、往来函件等，以维持合作关系。再者，评估合同被盗可能带来的风险。包括商业秘密泄露、合同权益受损等方面。若存在风险，可咨询专业律师，根据具体情况制定应对策略，如采取法律手段追究侵权人的责任等。最后，加强合同管理的安全防范措施。完善合同存储制度，采用加密存储、专人保管等方式；对涉及合同的人员进行安全培训，提高保密意识；建立健全合同管理流程，加强对合同流转环节的监控。

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